威康桑格研究所利用 NVIDIA 加速计算推进癌症研究

据 NVIDIA 博客发布消息称，人类基因组计划的重要贡献者威康桑格研究所正在利用 NVIDIA 的加速计算技术来加强其癌症研究工作。

加速基因组分析

该研究所位于英国，拥有世界上最大的测序设施之一，读取了超过 48 PB 的 DNA 和 RNA 序列。这种广泛的数据收集有助于了解健康和疾病机制。具体来说，该研究所的癌症、衰老和体细胞突变 (CASM) 项目每年对数万个癌症基因组进行测序和分析，以研究突变过程和治疗效果。

为了管理这些大规模项目，威康桑格研究所正在探索使用 NVIDIA DGX 系统和 NVIDIA Parabricks，后者是一款基因组学分析软件套件，可利用加速计算来高效处理数据。CASM 首席软件开发人员王静伟强调，NVIDIA 的解决方案将节省大量时间、成本和能源，使该研究所能够更有效地处理数十万个体细胞样本。

减少运行时间和能耗

该研究所已开发出用于全基因组功能筛查和药物测试的高通量模型。通过集成 NVIDIA 加速计算和软件，它显著减少了每个基因组的运行时间和能耗。具体而言，与使用 128 台双插槽 CPU 服务器相比，在 NVIDIA GPU 上使用带有 Parabricks 的 Burrows-Wheeler Aligner (BWA) 可将运行时间缩短 1.6 倍，将成本降低 24 倍，并将能耗降低 42 倍。

该研究所每年对 10,000 个基因组进行测序需要耗费大约 1.25 亿个 CPU 小时。通过切换到使用 GPU 上的 Parabricks 的 BWA，该研究所每年可以节省大约 100 万美元和 1,000 兆瓦时的能源，相当于一个普通美国家庭使用一个世纪所需的能源。

与行业领袖合作

桑格研究所的 NVIDIA 加速测序实验室充当着一个 AI 工厂，在这里，数据被转化为可操作的情报。这种 AI 工厂模式利用全栈加速计算平台来处理计算密集型任务。

该研究所与施耐德电气等行业领导者合作，优化数据中心设计，提高能源效率和性能。施耐德电气以其在能源管理和自动化方面的专业知识而闻名，它帮助减少数据中心停机时间，并为 DNA 测序实验室配备不间断电源和先进冷却系统等关键技术。

在NVIDIA GTC大会上，施耐德电气宣布发布针对NVIDIA加速计算集群量身定制的AI数据中心参考设计，旨在增强数据处理、工程仿真、电子设计自动化、计算机辅助药物设计和生成式AI，重点关注大功率配电和液冷系统。

本周，威康桑格研究所、施耐德电气和 NVIDIA 的代表将在纽约气候周小组讨论会上讨论他们的合作努力，该小组由 《经济学人》。

如需了解更多信息，请访问 NVIDIA 博客。

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