劳伦斯·詹格(Lawrence Jengar)
2025年5月19日20:45
Atgenomix seqslab通过整合NVIDIA的抛物线和火花 – 雷维来增强精度医学,从而实现可伸缩的健康法分析,以实现个性化治疗策略。
在不断发展的医疗保健景观中,精密医学正成为个性化治疗策略的基石。根据NVIDIA的博客,这种转型的核心是Atgenomix Seqslab,这是一个尖端的平台,旨在利用健康OMICS Insights用于精密医学。
健康法学数据的计算挑战
将电子病历(EMR)与基因组和其他OMIC数据集成在一起提出了重大的计算挑战。单个全基因组测序(WGS)数据集可以超过300 GB,并且与蛋白质组学和代谢组学结合使用,数据可以达到PBABYTE量表。这需要大量的计算资源和安全处理,以遵守HIPAA和GDPR等法规。
Atgenomix Seqslab的高级平台
Seqslab通过利用Nvidia Parabricks和Rapids加速器来解决这些挑战(Spark-Rapids)。这种整合加速了大规模基因组和EMR数据的处理,从而使临床医生能够迅速做出明智的决定。 Seqslab的Data Lakehouse功能使基因组信息与临床解释相结合,从而增强了决策过程。
加速基因组分析
抛物线通过利用GPU加速度大大减少了基因组分析所需的时间。例如,使用NVIDIA T4 GPU可以在10分钟内完成30倍整体基因组测序的变体,这一任务传统上花费了数小时在CPU上。
启用可扩展数据处理
Spark-Rapids具有加速SQL查询和机器学习任务的能力增强了下游分析。培训模型,例如用于癌症类型分类的XGBOOST,随着GPU加速度的速度,训练模型的速度越来越快,从而可以快速见解和临床应用。
实施精密医学工作流程
Seqslab自动化整个精密药物工作流程,从原始测序数据到可操作的见解。该平台的可伸缩性和合规性解决方案可确保有效地处理大型数据,从而支持医院和研究机构,以推动精密医学。
通过整合尖端的技术,Atgenomix Seqslab准备通过实现更快的诊断,个性化治疗和加速药物发现来改变医疗保健行业,从而实现Precision Medicine的最终目标。
有关更多见解,请访问原始的NVIDIA博客。
图像来源:Shutterstock
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